Коричневые пятна на хвойных растениях могут быть вызваны целым рядом причин. Болезни, вредители, условия содержания и неправильный уход – все эти факторы могут вызвать эту проблему. Коричневые пятна могут появиться на любых хвойных, но наиболее подвержены этим проблемам туи, кипарисы и их гибриды.  
Причины, вызывающие коричневые пятна на хвойных растениях
Вредители
Тля кипарисовая (Cupressobium cupressi) и тля туевая (Cupressobium tujafilinum) распространенная причина возникновения коричневых пятен. Заражение тлей растений может привести к вторичному заражению грибами, которые будут развиваться на сладких выделения тли.
Червецы также могут стать причиной коричневых пятен. Большие по площади поражения эти насекомые могут вызывать только на кипарисах и их гибридах. На остальных хвойных, где возможно будут обнаружены червецы, причина вызвавшая появление коричневых пятен, скорее всего, будет другой.
Болезни
Грибковое заболевание  Pestalotiopsis вызывает отмирание частей растения. Этому заболеванию подвержены многие хвойные растения. Основным симптомом является побурение побегов, затем их отмирание. Многочисленные тонкие черные нити спор на пораженных местах видны невооруженным взглядом. Кроме появления коричневых пятен и отмирания тканей, р астения становятся слабыми и уязвимыми к другим инфекциям и вредителям. Гриб активно развивается летом во влажных условиях.
Грибковое заболевание фитофтороз, вызванное  Phytophthora,  поражает корневую систему хвойных, вызывая появление  коричневых пятен и отмирание ветвей. При фитофторозе растения могут погибать. Развивается при повышенной влажности почвы, отсутствии дренажа. При обнаружении этого заболевания необходимо провести санацию, как растений, так и почвы.  
Условия содержания
Причиной появления коричневых пятен на хвойных растениях во многом могут стать природные факторы: обморожения, солнечные ожоги, недостаток влаги ведут или заболачивание, а также сильное воздействие ветра. Если в местах, где растут хвойные, есть неблагоприятные факторы, нужно взять их под контроль и защитить растения от их пагубного влияния.
Если растение покрывается коричневыми пятнами в первые два года после посадки или пересадки, то, скорее всего, причиной стали плохая техника посадки или недостаток влаги.
Старые хвойные растения часто подвержены коричневым пятнам. Стоит помнить, что омолодить хвойные растения методом обрезки нельзя. 
Неправильный уход
Коричневые пятна могут вызываться неправильным применением удобрений, когда растение получает химический ожог, вследствие нарушения дозировки или применения средства с неподходящим составом. 
Также замечено, что отмирание ветвей и появление коричневых пятен появляется после обрезки растений осенью. Обрезка в затяжную сухую или ветреную погоду также может спровоцировать появление пятен.
Старые хвойные растения часто подвержены коричневым пятнам. Стоит помнить, что омолодить хвойные растения методом обрезки нельзя. Они не в состоянии восстановить обрезанные части, кроме этого, могут погибнуть, если обрезка была радикальной.
Профилактика и контроль
•    Обрезку хвойных растений следует проводить весной и летом, осенняя обрезка наиболее опасна.
•    Обрезку хвойных растений не следует проводить в жаркую и сухую погоду.
•    Не обрезать радикально старые деревья.
•    Удобрять хвойные растения нужно регулярно, используя при этом правильные дозировки. 
•    Утеплять в зимний период подверженные вымерзанию растения.
•    Позаботиться о дренаже там, где растут хвойные.
•    Не допускать пересыхание почвы в жару, а также мульчировать ее.
•    Контролировать появление вредителей, при обнаружении использовать инсектициды для их уничтожения.
•    Молодые и недавно пересаженные растения должны находиться под особым контролем.